최근에 대입 입학사정관전형에서 부정행위가 있었다는 의혹이 제기되면서 입학사정관제의 부작용을 지적하는 비판들이 잇따르고 있다. 이런 비판들의 근저에는 이 제도가 우리 현실에 맞지 않다는 부정적 인식이 짙게 깔려 있다. 시행 2년 만에 불거진 문제점들이 하나같이  힘에 벅찰 만큼 해결하기 어려운 것들이지만, 입학사정관제는 신뢰 사회 구축에 일조할 수 있는 파급력이 있기에 반드시 정착시켜야 할 것이다.  
  이제껏 제기된 문제점들 중에서 대부분은 우리의 결연한 의지와 지속적인 노력으로 헤쳐 나가야만 한다. 정보 부족으로 입시 관계자들이 혼란스러워한다면 제도를 정비하고 체계적으로 홍보하여 안정시켜야 할 것이다. 또한 대필된 자기소개서나 위조된 경력증명서는 다단계 심층면접과 다양한 현장조사가 실시되면 발을 붙이기 어려울 것이다. 그리고 사교육비의 증가는 유능한 교사의 양성과 공교육의 적성 개발 프로그램으로 어느 정도 억제할 수 있을 것이다. 말만 쉽게 한다고 항변하는 사람도 있겠지만, 이런 노력들은 어떠한 어려움이 있어도 창의적 인재 양성과 공교육 정상화를 위해서는 반드시 해 내야 한다.
  정작 가장 우려되는 점은 평가자의 공정성을 의심하는 사회 분위기이다. 입학사정관제는 학생의 학업성취도뿐만 아니라 인성, 소질, 잠재력 등을 두루 살펴서 학생을 선발하는 제도이기에 아무리 평가지침을 세밀하게 마련해도 사정관들의 판단이 가장 중요하다. 그래서 사람들이 사정관들의 소신과 능력을 믿지 못한다면 입학사정관제는 정착될 수 없다. 시험 성적 위주의 입시제도가 낳은 심각한 부작용을 체험했으면서도 이 굴레에서 쉽게 벗어나지 못하는 이유는 바로 시험 성적은 믿되 사람은 믿지 못하는 사회 분위기 때문이다.
  입학사정관제가 아직 시기상조라는 주장은 현실적일 수는 있지만 소극적인 견해이다. 성적 중심의 학교교육 안에 머물러 있으면서 세상이 바뀌기를 기다려서는 안 된다. 이 제도가 신뢰를 먹고 자란다면, 우리는 입학사정관제를 정착시키기 위해 신뢰라는 양분을 더 크게 키우려는 생산적인 자세를 가져야 한다. 우리 사회는 인간적이고 창의적인 인재들이 마음껏 활동할 수 있는 세상을 만들어야 하는 책무를 갖고 있다. 입학사정관제가 비록 다양한 사회제도들이 이루는 숲 속에서 자라는 조그만 나무에 불과하지만, 학생들의 인간적인 창의성을  키우고 신뢰 사회를 만들어 가는 데 기여하는 제도라면 산적한 문제점들과 맞서 싸우면서  발전시켜 나가야만 한다.